CLADÍSTICA: MÉTODOS CUANTITATIVOS DE CLASIFICACIÓN Y USO DE TNT

DIA 1 Teórico: Parsimonia y sistemática filogenética. Optimización y mapeo de caracteres(mapeo/reconstrucciones/cambios específicos).                                   Práctico: Input/output. Formatos de datasets. Archivos de instrucciones. Opciones de output como metafiles; creación de abatch filesa. Edición de árboles. Manejo de archivos de árboles. Grupos de árboles caracteres y taxones.

DIA 2 Teórico: Búsquedas parte I. Soluciones exactas árboles de Wagner branch-swapping. Optimos locales y óptimos globales; estrategias de búsqueda. Factores que afectan la eficiencia de las búsquedas.                  Práctico: Uso de secuencias múltiples de adición al azar. Constraints y a timeoutsa. Estrategias de búsquedas heurísticas.

DIA 3 Teórico/Práctico: Reglas de colapsamiento. Consensos (incluyendo: mejoras de consensos y superárboles). Comparaciones de topologías de árboles; distancias de SPR. Pesado de caracteres. Funciones de pesado definidas por el usuario.

DIA 4 Teórico/Práctico: Medidas de soporte. Soporte de Bremer; búsqueda de árboles subóptimos. Medidas basadas en remuestreo; efectos de tipos de búsquedas y reglas de colapsamientos.

DIA 5 Teórico/Práctico: Búsquedas parte II: Nuevos algoritmos de búsqueda. Análisis de datasets de gran tamaño; estrategias generales. Scripts; control de flujo expresiones y variables.

Curso Teórico/práctico con fuerte énfasis en los aspectos prácticos.

Las clases teóricas se usan para introducir la problemática general en cada tema y los prácticos se utilizan para ilustrar y terminar de entender los temas vistos en las clases teóricas. La dinámica del curso es bastante informal pasando de modalidad teórico a modalidad práctico rápidamente y a requerimiento de los participantes.

ES NECESARIO LLEVAR ORDENADOR PERSONAL